Gamera se sacrifie et meurt en sauvant la vie d'un jeune garçon attaqué par une horde de Gyaos. Trente ans plus tard, le fils de ce garçon découvre un oeuf qui, après éclosion, révèle un nouveau Gamera. Les deux deviennent des amis fidèles et le petit monstre grandit rapidement. Le jeune Gamera découvre peu après ses pouvoirs, et un nouveau monstre menaçant appelé Zedus fait son apparition. Le jeune Gamera pourra t'il s'opposer à lui ?...